Вернувшись в Копенгаген, Брандес в 1871 приступил к чтению университетского курса лекций, опубликованных в 1872–1890 под названием Главные течения в европейской литературе 19 в. (Hovedstrninger i det nittende aarhundredes litteratur), которые явились откровенным вызовом царившему тогда интеллектуальному консерватизму и застою. В 1875 он опубликовал датский перевод книги Дж.С.Милля Угнетение женщины.

Жил в Германии, где написал работы Датские поэты (Danske digtere, 1877), Эсайас Тегнер (Esaias Tegner, 1878), Бенджамин Дизраэли (Benjamin Disraёli, 1878), Писатели и произведения новой европейской литературы (Mennesker og vrker i nyere europeisk litteratur, 1883), Людвиг Хольберг (Ludvig Holberg, 1885) и другие значительные критические и литературоведческие труды. Во всех своих работах Брандес проявил себя непоколебимым поборником реализма и противником общепризнанных авторитетов и догм.

Среди главных работ Брандеса – монография Уильям Шекспир (William Shakespeare, 1895–1896) и Хенрик Ибсен (Henrik Ibsen, 1898). В течение двух последних десятилетий своей жизни им были созданы такие значительные биографические произведения, как Вольфганг Гёте (Wolfgang Goethe, 1914–1915), Вольтер (Voltaire, 1916–1917), Гай Юлий Цезарь (Cajus Julius Caesar, 1918) и Микеланджело Буонаротти (Michelangelo Buonarotti, 1921). Умер Брандес в Копенгагене 19 февраля 1927.